Recientemente tuve que configurar un servidor de svn en windows por necesidades laborales, en un principio pense en montar todo de la forma más simple con una aplicación en consola, tan simple como seguir los pasos que alguna vez había posteado [1].
Para esto resultó que baje los archivos actualizados para estar al día y cuando intento validar que todo funciona manda un bello y grandioso:
Expected format '2' of repository; found format '3'
Así que opte por buscar alternativas, primero probe ColabNet:

• Bonito instalador
• Alta automática del servicio simple y después .. sucedio lo mismo.

Luego intente con sublime:

• Instalador sencillo
• Configuración simple
• Agradable interfaz web, pero el cliente mando el mismo MF error.

No desespere y continue hasta encontrar uno que cubriera mis necesidades, aunque sea un instalador viejo, pensé:
Instalé VisualSVN y ese si cubrio mis requerimientos:

• Administración sencilla
• Manejo de repositorios de forma visual
• Publicación web (soporta https)
• Administración de usuarios y permisos amigable
• Error de cliente solucionado, este si es un cliente compatible con el servidor

No cabe duda que cada vez es más sencillo usar desarrollos Open Source en windows.

[1] http://es.iver.com.mx/index.php?blog/show/Howto_para_configurar_subversion_en_windows_segunda_entrega.html